在基本养老保险基金投资运作初步开展的阶段，一些可能存在的挑战也引发市场的关注。目前，地方基本养老保险基金归集后，统一委托给全国社保基金理事会。而从理事会自身情况来看，其投资运营既有直接投资，又有委托（间接）投资，且已改变了初期的以委托投资为主、以直接投资为辅的格局，多年来逐步提高直接投资比重，增大了直接投资的力度。
中国证券报记者从有关方面了解到，截至2016年底，全国社保基金资产总额达20427.55亿元，权益总额达19492.34亿元。全国社保基金理事会自2000年成立以来，年化平均投资收益率跑赢CPI。2016年，全国社保基金理事会制定了基本养老保险基金的战略资产配置计划，将投资目标设定为5年年均收益率至少较5年期记账式国债平均发行利率高一个百分点。与此同时，地方基本养老保险基金的投资目标能否实现，对于全国社保基金理事会而言，仍是一个挑战。
权威人士表示，2015年，全国社保基金的投资收益率较高，为地方委托基本养老保险基金投资运营带来了信心，但实际上，对于基金的投资业绩考核，应当考虑平滑收益率的因素。“2016年全国社保基金的年化投资回报率不到2%，已实现投资收益率超过5%，与2015年的业绩有明显差别，这是由于市场变化所导致的。基本养老保险基金投资运营各方都应当从全局来对未来的收益进行整体判断。”
“全国社保基金过往的业绩里既体现政策性的因素，也体现专业性的因素。未来，国家有关部门应考虑对基本养老保险基金有适当的政策倾斜，以推动这笔‘养命钱’更好地保值增值。”专家认为。
“全国社保基金理事会受托的社保基金已获得了一些不错的项目投资机会，而基本养老保险基金可能没有抢占到这样的机会。另外，社保基金和养老金在投资权益类资产的比例限制上有所不同。未来，二者的投资收益率可能会因为类似这样的因素而出现一定差异。如何完善资产配置策略，提升投资运营水平，无疑是全国社保基金理事会下一步必须要考虑的问题。”权威人士表示。
