“影响新老农保衔接的主要原因是老农保账户的亏空”，崔红志说，“一方面是并非个例的养老金被贪污、挪用，另一方面是多年来仅仅做活期存款的养老金在通胀中消失了”。

　　邓州市槐树村村民吴文喜购买了“新农保”，每年缴费100元，60岁后可以每月领取60元。这是因为“新农保”实行“个人缴费、集体补助、政府补贴”的原则，尽管同“老农保”一样，“集体补助仍然是一句空话”，崔红志说。但“政府补贴”开始为农民带来实惠。

　　不过吴文喜仍有忧虑。她在外打工多年，打工企业给她办了城镇基本养老保险，但她回乡务农后，却无法将这笔养老金转回来，“政府说必须找一家企业挂靠才能转”，吴文喜说。

　　这亦非孤例。崔红志分析，“地方政府不愿农民将打工时的基本养老保险转入"新农保"，是因为农民缴费越多，政府补贴越多”，其背后原因在于地方政府不愿承担“新农保”给财政带来的负担。

　　现在“新农保”的设计为139个月后个人账户的资金兑付完毕，也即个人账户在71.5岁时被领完，这之后的养老金兑付由政府承担。“如今农村老人活过71.5岁已很普遍，而政策中对这之后的养老金由哪级财政承担还是空白，造成地方政府积极性不高”，崔红志说。

　　新华社7月6日报道称，2012年，我国“新农保”有望实现全覆盖。截至2011年底，我国已有1914个县纳入国家“新农保”试点，超过总数的80%。

　　邓州市槐树村村民吴文喜也说，村里80%的人都买了“新农保”，“但几乎都是买的每年100元的最低档”。

　　目前，国内多数地区按照《国务院关于开展新型农村社会养老保险试点的指导意见》（以下简称《指导意见》）的规定，将缴费标准定为每年100元至500元5个档次，或略有提高。而有的地区则较大幅度地增加缴费档次和提高缴费标准。比如，宁波市将个人缴费标准定为每年100元至2000元8个档次，温州

　　市为100元至2000元7个档次。

　　这被认为“新农保”存在“保富不保贫”的公平疑虑。

　　除了大多数地区对“新农保”个人缴费实行定额制，少数地区还实行比例制。比如宁夏规定，村干部参加新农保的个人缴费及补贴标准为，个人按照川区和山区上一年度农民人均纯收入的16%缴费。

　　浙江大学公共管理学院博士后肖金萍在一篇发表于2010年的论文中说，“各地新农保具体制度设计差别大，会造成养老金待遇差别过大，有违"保基本、广覆盖"以及基本公共服务均等化的基本原则”。

　　陷入公平性质疑的还不止缴费标准差异，“新农保”养老金待遇构成也存在差异。大部分地区的养老金待遇由基础养老金和个人账户养老金组成，而少数地区的养老金待遇则由基础养老金、缴费年限养老金和个人账户养老金三部分组成。且各地基础养老金待遇相差悬殊，最高的北京市，每人每月280元，低的地区只有55元。吴文喜所在的邓州市即为每月55元，再加上县政府补助的每月5元。这亦被肖金萍认为“新农保”公平缺失的表现。

　　除了“富人”多缴多得，“新农保”还对多缴者实行多补贴。《指导意见》规定，新农保实行社会统筹与个人账户相结合，对个人选择较高档次标准缴费的，地方政府可给予适当鼓励。

　　温州市就规定，按100元档次缴费的，每人每年给予30元缴费补贴，按300元档次缴费的，每人每年给予35元缴费补贴……按2000元，即最高档次缴费的，每人每年给予100元缴费补贴。

　　也就是说，按最高档次缴费者所获得的地方财政补贴，为按最低档次缴费者的3.3倍。而那些因无力缴纳应缴保费，只好选择不参保的困难农民，得不到任何财政补贴。这被肖金萍认为缺乏社会共济，存在逆向收入再分配问题。

　　在肖金萍看来，“新农保”存在公平性的质疑首先是因为地方各级财政责任不明确。“新农保”基础养老金部分，中西部地区由中央财政承担，东部地区则由地方财政承担50%。“这是考虑到东部地区省份经济发达，财政收入情况较好”，中国社科院农村研究所副研究员崔红志说。

　　但这地方财政承担的50%却未明确规定由哪级财政承担，造成在部分地区，大部分投入推给了市县财政。

　　对于“新农保”的公平性悬疑，亦有学者表示不同意见。“"新农保"的设计是加强缴费与权益的联系，鼓励多缴”，中国社科院世界社会保障中心主任郑秉文说，“按照目前农民的人均可支配收入，每年缴500元也不是问题”。