1、普通住院补偿
对政策范围内的费用，按不同医院级别和不同住院例均费用水平分别设置起付线及补偿比，实行“分段、分比例”方法进行补偿，年度封顶线100000元（各级医疗机构具体补偿比例政策按全省统一指导意见执行）。
对AAA医院其住院补偿比例在分段补偿标准的基础上相应提高5个百分点，对A医院其住院补偿比例在分段补偿标准的基础上相应降低5个百分点。
2、住院单病种补偿
对住院部分病种（2012年纳入34种，与上年比较新增15个病种）纳入单病种实行定额付费方式补偿。即参合患者在开展单病种付费的定点医疗机构住院时，只需先交纳单病种规定的自付费用部分，出院时，到定点医疗机构合管科按市统一补助标准办理补偿手续。超出限价标准的部分，一律由医疗机构负担，合作医疗基金及住院患者均不予支付。
3、重大疾病提高医疗保障水平补偿
为进一步降低重大疾病参合患者的个人支付比例，对以下15种疾病实行提高医疗保障水平补偿。
(1)儿童“两病”（6个病种）补偿：
对符合提高医疗保障水平的0～14周岁（含14周岁）儿童先天性心脏病（先天性房间隔缺损、先天性室间隔缺损、先天性动脉导管未闭、先天性肺动脉瓣狭窄）及儿童白血病（儿童急性淋巴细胞白血病、儿童急性早幼粒细胞白血病）在定点医疗机构住院的，实行“费用包干、定额结算”方式补偿。
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