上海医疗局对于一个孩子同时参加少儿基本医疗保障和少儿住院互助基金后如何报销，也给出了明确的说法：“这两项制度是基本社会保障与互助共济保障的关系。凡参加少儿住院互助基金的对象，发生的住院和门诊大病医疗费，先由少儿学生基本医疗保障基金报销一半，其余的医疗费用由少儿住院互助基金给予支付。”
个人缴费标准：
少儿
医保的个人缴费标准2011年新规定是80元。而市少儿住院基金的个人缴费标准是：0-5岁婴幼儿、学龄期未入学残障少儿60元一学年；学龄期学生（含辍学生、复读生）50元一学年，
享受的医保待遇：
少儿医保享受的医保待遇是：全年累积300元以上才可以报销①门急诊，在一级医疗机构就医的，支付比例为65%；在二级医疗机构就医的，支付比例为55%；在三级医疗机构就医的，居民医保基金支付比例维持不变，仍为50%。②住院支付比例仍为50%。少儿住院基金可享受的待遇是：少儿一旦患病住院，支付起付线标准以上部分住院费用的50%（（起付线：I级医院50元，II级医院100元，Ⅲ级医院300元）；），对患白血病、血友病、再生障碍性贫血、恶性肿瘤出院后的专科门诊费用，以及接受肾移植前的透析费用和手术后的抗排异药物费用，也可支付50%。
以一名12岁少儿下肢骨折病人为例，患儿在某三级医院接受住院手术治疗并进行手术拔钉，两次住院期间家长共花费25000元，扣除采用进口手术材质等不能报销费用外，其中符合报销条件的费用共18500元。按居民医保规定可报销50%，即9250元。再按少儿住院基金规定扣除300元起付线标准外，还可报销8950元，两者相加共计可报销18200元，家长自付仅6800元。
缴费时间
少儿住院基金的缴费时间是每年的9月1日到9月30日；少儿医保2011的缴费时间是2011年1月20号-3月31日。如果没有上学的到户口所在地办理，已上学的就由学校统一办理。
