北京大学深圳医院、深圳市中医院、深圳市龙岗中心医院、深圳市福田区第二人民医院（梅林医院）、深圳沙井人民医院、深圳市福田人民医院。
难点
三市结算平台的对接
据了解，三市社保卡互通的难点在于电脑结算平台的对接、三大目录的备案整合和编码互通等。而由于信息平台以往从没互通过，互通过程需要加入软件设施和设备，耗时需数月。
“药品目录、诊疗项目和基础设施三大目录，三市各有不同，因此需要在东莞的社保局进行备案。”龙岗中心医院有关负责人表示。
“三大目录中，个别项目的编码，三地是不一样的，要实现现场结算的话，系统需要兼容。”深圳沙井人民医院表示。而福田区第二人民医院有关负责人则表示，三地联网的前提社保部门制定统一的标准实现编码的互通，而目前该院并没有收到社保部门的通知。
而深圳北大医院办公室相关工作人员表示，目前还需社保和卫生部门具体的一些协议细则出来，医院才能进行端口对接。
注意：
现场结算仅限住院病人
据了解，按目前的进度，结算系统互通后，东莞市民在深圳的定点医院看病实现异地结算仅限于住院看病，门诊病人暂不计入。
4月初，东莞社保局派人过来选定了6家医院，此前按照深莞双方的商量，本来是计划这个月中签约，深圳市拟签约的医院一直在接受新业务的培训，但是由于涉及系统连接和程序匹配改造的问题，而延迟了相关协议签订。
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