(一)改革会计核算基础，采用收付实现制与权责发生制相结合的核算办法
基本医疗保险基金执行"收付实现制和权责发生制相结合"的会计核算基础是可行的，它既可解决现行收付实现制核算基础存在的局限，满足政府对医疗保险基金实行宏观管理的需要，又能提高医疗保险基金财务数据的透明度和真实性。
笔者认为，对能预计的基本医疗保险基金的收支，如医疗保险费的征缴，应计利息的计提等。应采用权责发生制。
因为《社会保险费征缴暂行条例》明确规定，缴费单位、缴费个人应当按时足额缴纳社会保险费：缴费单位应当以货币形式缴纳社会保险费：社会保险费不得减免；缴费单位和缴费个人逾期不缴纳社会保险费和滞纳金的。由劳动保障行政部门或税务机关申请人民法院强制执行。
这说明，社会保险经办机构一旦核定某单位或个人应缴的基本医疗保险费，缴费单位或缴费个人就必须缴纳，即使缴费单位或个人因各种原因导致暂时资金周转困难，也只能缓交而不是免交，并按规定还要交付一定的滞纳金，这就形成了经办机构的"隐性债权"。
经办机构应设置"应收医保费"科目来核算保费的清欠情况，经办机构财务部门应根据缴费核定额将单位或个人欠缴保费计入"应收医保费"科目，待实际收到保费时再冲减"应收医保费"科目，"应收医保费"科目应根据单位或个人建立明细账：同样的办法适用于利息的计提和归还。
对其他医疗保险基金的收支。则可采取收付实现制，于实际收到或支出款项时列支或列收。只有这样，才能真实反映医疗保险基金的财务运行状况和财务成果，正确反映医疗保险基金的持续能力，为政府规避风险、实施稳健的发展战略、制定长期的发展政策提供依据。
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