作为支付方的医保与医疗机构进行博弈的最重要的工具是付费方式。医院希望通过推广支付方式改革；利用“经济杠杆”对医疗机构和医疗行为发挥监管作用；甚至进而促进“以药养医”格局的改变来推动公立医院改革。
近期，北京市试行按病种分组付费，上海市实行总额预付制，江苏省镇江市实行以人头付费为基础的复合式付费方式在多种场合被提及，在下一步的医保支付方式改革的模式选择中，或许会中选。
实际上，北京的按病种分组付费刚刚开始试点，短期内难推广；上海的总额预付制虽有试点的基础，也要明年才能全面推广；地级市的“镇江模式”之所以能与北京、上海并列，很大程度上在于其在医保支付方式改革上超过10年的经验和相对完备的制度安排。
现实中，“镇江模式”的含义宽泛而模糊。各方面推崇“镇江模式”的动机也不尽相同。例如，卫生部门就是因为其“社保部门负责筹资、卫生部门负责支付”，而推崇“镇江模式”。镇江医保方面的人士则表示，在管办尚未分离条件下，卫生行政部门用支付方式监管公立医院仍是“老子管儿子”的格局，这是镇江在上世纪90年代启动医保改革时的遗留问题，这一格局实际上不利于对医疗机构的监管。
镇江的支付方式改革也经历多个阶段的政策调整，最后形成的“复合式付费方式”宛如多种药物组合在一起的“鸡尾酒疗法”，用以克制公立医院产生种种不合理医疗费用。
一位地方医保官员表示，医保（的监管措施）和公立医疗机构（不合理医疗费用产生）之间的博弈如同抗生素和细菌的关系，“吃一段时间可能就不灵了，就像抗生素一样，过一段时间就得换药”。公立医院被比喻为“细菌”实在是讽刺。
虽然，镇江的“复合式付费方式”在现有的支付方式改革试点中，表现尚佳，达到了某种“博弈下的均衡”，但其在公立医院改革迟滞的大背景下，仍远未完成制度建设。镇江市的医保部门困则思变，正在谋求更进一步扩大权限，对医疗机构有更强的监管力度。
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