最不被看好的依旧是化学原料药子行业。在人民币升值和出口价格低迷的背景下，化学原料药行业陷入了以降价换取出口量的恶性循环。数据显示，今年前三季度，我国原料药出口增长28.1%，大部分品种价格下跌明显。业内专家表示，降价搏量仍将是明年相关企业的无奈选择，而这在削弱龙头企业营利能力的同时，也将使一些中小原料药企业难以为继。
而对于整个医药产业而言，当前乃至明年医药行业增速的理性调整或将对医药产业结构调整带来影响。“中国医药行业正从野蛮生长走向精耕细作，产业升级已经成为行业继续快速发展的必由之路。另外一方面，产能释放带来的竞争压力扩大，将进一步促进医药产业集中度的提升。而在国资委推动下，明年医药行业的重组速度预计也会加快”曹明分析指出。
但也有专家表示，医药产业的结构性矛盾短期内无法逾越，明年产业结构升级难见大的成效。
较为确定的是，当前的医药经济已经全面进入资本主导时代，资本将对改造医药产业结构发挥极大的作用。据了解，2010年，IPO的医药企业数量为24家，为历年之最。今年前三季度，上市医药企业为22家，总融资规模29亿美元，第二轮上市高潮已经袭来。林建宁表示：“新版GMP改造、扩产、兼并，以及企业的自主创新，都有较大的融资需求，并购正在加速改变产业格局。2012年，资本将继续主导产业的兼并重组，医药产业的集中度将进一步提高;而自主创新热潮也将悄然兴起，转型升级必将提速。”
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