但一个新的问题摆在子长县公立医院面前。“药品配送不及时非常要命。”吴建军说，开始运行的时候，药品配送总的来说还是不错的，最低能达到92%，基本能在48小时内配送到位。而现在有些药品很难及时到位，或者根本就配送不了。
子长县配送中心通过三轮竞价一轮议价，把供药企业药价压的极低，有些药基本没有利润，这导致药厂不愿再给供货企业供货。吴建军介绍，“比如青霉素V钾，给子长县才两块多钱，其他地方是八块多，扰乱了制药企业的市场。”因此，有些药厂就不再给陕西药材公司东城采购站供货。
“比如我们要某种药6000支，他们只能供1000支，因为没有货，有时候会配送很慢，很误事。”吴建军说，这不能怪配送中心，更不能怪供货企业，这里需要国家层面协调。
县医改办主任靳晓宏认为，药品流通问题如果国家层面不解决，仅靠地方政府很难解决。药品在流通领域层层加价幅度太大，国家必须在药品的定价上或者在制药厂上面想办法，从根本上把虚高的价格压下来。
还有药品三统一问题，陕西是以省为单位来进行公开招标，但每一个市、县的用药习惯不一样，这需要政策更灵活一些。靳晓宏建议，以省为单位太大，最好是以县为单位，或以地市为单位。这样在一个地区里，药品的价格基本是一个水平。这样才能真正解决看病贵的问题。
城市三甲医院扩张制约县级医改子长县有27万人口，是延安市人口第一大县，子长医改对于延安、陕西，乃至全国意义重大。2010年11月，全国县医院改革与发展现场会在子长举行，卫生部称：“子长模式”是一种较为全面的公立医院改革模式、理想化的模式。
延安市发改委副主任、医改办副主任杨志旗称，陕西省政府要求从延安开始，借鉴子长模式，先在延安13个县区全面推进县级公立医院改革，从而使“子长模式”上升为“延安模式”，再加以推广。这也是国务院医改办主任孙志刚的意见。延安市已于10月25日召开全市县级公立医院改革推进大会。目前，全国整市推进县级公立医院改革的市只有延安一家。
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