2、在个人所得税方面
由于企业年金分月缴费时不与当月工资薪金合并计税，实际上是税收制度给员工个人又提供了一次重新适用低级次税率的机会，给企业设计员工薪酬制度带来了新的筹划点。同时，企业应注意企业年金的缴费方式。国税函[2009]694号文规定，企业年金按季度、半年或年度缴纳企业缴费的，在计税时不得还原至所属月份，均作为一个月的工资、薪金，不扣除任何费用，按照“工资、薪金所得”项目适用税率计算扣缴个人所得税。个人取得的工资薪金收入应于个人实际取得时计算缴纳个人所得税，对于个人一次性取得原本可能属于不同月份的工资薪金，都不允许进行分摊。由此可见，相对按季度、半年或年度缴纳企业缴费而言，按月缴纳企业缴费的，税负相对较轻，对员工更加有利。
3、国税函[2009]694号文还规定，对因年金设置条件导致的已经计入个人账户的企业缴费不能归属个人的部分，其已扣缴的个人所得税应予以退还。具体计算公式如下：
应退税款＝企业缴费已纳税款×（1－实际领取企业缴费／已纳税企业缴费的累计额）
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