针对公立医院药品零差率销售，芜湖采取的是“一升、一降、一增、一兜底”的补偿思路。“一升”是指适当提升部分医疗技术服务收费标准；“一降”是指降低部分大型设备检查的费用；“一增”即增设药事服务费；“一兜底”是明确各项补助不足以弥补医院取消药品加成所减少的收入时，由财政负责兜底。
“不能这边取消药品加成，那边提高医疗服务价格，老百姓更会指责你。”马鞍山市市立医疗集团总院长何少峰认为。
马鞍山市市立医疗集团2008年成立，由原市卫生局下属的市人民医院、市妇幼保健院等五家公立医疗机构组成。取消药品加成收入以后，集团减少收入2000多万元。
何少峰介绍说，该集团药品器械采购管理中心与马鞍山市医药有限公司（市立医疗集团持有50%股权）联手，对于临床利润比较大的品种，通过医药公司进行二次谈判，从而把药价中的“水分”挤掉。借鉴上海“闵行模式”经验，通过压缩药品供应链争取一部分补偿。
同时，政府对历史债务、融资负债给予补助，剩余的损失则由集团自己消化一部分。“基本上问题不是太大，差不多有三四百万元的损失。为医改付出也是应该的。”何少峰说。
根治以药养医
可以预见，取消药品加成将导致医疗机构收入减少，同时也会一定程度上触动医务人员、药品流通企业或其他中介机构等群体的利益，卫生、社保、财政等部门之间的协调亦更具挑战性。
在一些医改研究人员看来，虽然取消药品加成会有一定积极作用，但影响有限，不能彻底解决“以药养医”的种种弊端。他们主要的担忧在于，这一做法不会改变二三级医院购销模式，难以从根本上切断医院、医务人员的灰色利益链。
力主破除以药养医的卫生部，希望以此来促进医药费用不合理上涨，减少药品滥用，同时遏制医务人员接受商业贿赂风险。改革初衷甚好，但一些公立医院院长并不看好改革的最终效果。
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